因为植物资源丰富，部分植物起源古老，珍稀濒危植物繁多，据调查，缙云山保护区现有植物246科、992属、1966种，其中国家级保护珍稀植物珙桐、银杉、红豆杉、桫椤等51种，有缙云四照花、缙云槭、北碚榕等模式植物38种有动物1071种，其中国家级保护珍稀动物草鸮、红腹锦鸡、雕鸮等13种。是长江中上游地区典型的亚热带常绿阔叶林区和植物种基因库，具有较高的保护价值和科学研究价值，是开展森林科考研究、生态教学实习及环境保护教育等活动的基地。