万州金陵中学是公办。

学校的前身是南京金陵中学。抗日战争爆发后，南京金陵中学于1937年12月西迁至原万县杨家花园（现沙河街道沙河社区）办学，1938年2月开学。

八年传薪，于1946年搬回南京。在万州办学期间，世界级火箭航天专家黄孝宗、小麦遗传育种学家王恒立、土壤农业化学家鲁如坤等杰出人才曾在这里就读。南京金陵中学也因此在万州留下了深刻的“老城记忆”。