朱国治死后，在1681年，即平定三藩之乱后，康熙帝命将驿站送朱国治得棺材及家属回京，次年康熙帝发上谕赞赏朱国治捐躯殉难，加赠户部右侍郎，予以厚葬，荫一子入国子监。应该说朱国治实为贪官酷吏，担任江宁巡抚期间，在奏销案，哭庙案中极尽严刑杀戮，在江南留下恶名。