区别在于效力不同。

行政事业单位的章分两种，一种是科室章，一种是法人章。

其中科室章一般是xx市（县）xx局xx科字样，不对外产生效力，只是在行政事业单位之间流转文件材料时使用。法人章一般都是xx市（县）xx局，直径比科室章稍大，对外有法律效力。