东帝汶大部地区属热带雨林气候，平原、谷地属热带草原气候，年平均气温26℃，年平均湿度为70%－80%。年平均降水量1200－1500毫米，但地区差异较大：北部沿海地区每年5月至11月为旱季，12月至翌年5月为雨季，年降水量为500－1500毫米南部沿海地区6月至12月为旱季，12月至翌年2月及5至6月为雨季，年降水量为1500－2000毫米中部山区年降水量为2500－3000毫米。