石头河流域的主要的污染源是工业点源（占比52.69%）和合流制溢流点源（占比23.68%）。

同时，通过对底泥中重金属含量和形态分析，结果表明底泥中超标重金属为Cr和Ni内梅罗污染指数PN=1.44，为轻度重金属污染底泥中的Ni、Zn、Pb、Cu以易迁移态为主，有重金属污染扩散风险推测重金属主要来自于河道附近的生活住宅区、工业区和交通区三种功能区。为实现石头河底泥安全处理处置，开展化学淋洗实验研究。结果表明，底泥经FeCl3淋洗后，可以满足园林绿化要求。