两所大学都是国家211工程大学，西南大学的农学部与东北农业大学农业学科旗鼓相当。但从两校综合实力上看，西南大学明显高于东北农业大学，西南大学不仅是农业学科，还涉及文，理，工，经，医，管，师范等多门学科。特别是师范专业，是教育部直属六所师范院校之一。