读音不同，含义不同，用法不同。

瞳孔：是动物或人眼睛内虹膜中心的小圆孔，为光线进入眼睛的通道。

例句：对方看上去心不在焉地在听，可他黑眼珠深处的瞳孔却在渐渐扩大，由此可以断定他满不在乎的神情下掩饰的是对该话题的强烈关注。

瞳仁：通俗意思指眼珠。

例句：她有着失了瞳仁的猜疑，性情急躁敏锐的耳朵四方八面地谛听着。