火焰龟腐甲是由于甲壳的损伤或压缩，使细菌侵入甲壳，导致甲壳溃烂或受损，细菌侵入创口导致甲壳腐烂。甲壳开裂、腐烂变软，外露或出血简称为腐败。龟的背部或腹部首先出现白色斑点，慢慢形成红色斑点，挤压硬血渗出，并有腐烂的气味。严重的甲壳类动物会在腋窝和臀部隆起的洞中溃烂。病龟会停止进食且行动迟缓，有缩头现象。表面甲壳腐烂，或形成洞穴，甚至可见肌肉，不进食，很少运动。