小热带鱼形状大多是扁平的。黑莲灯鱼体稍侧扁，与同属的其他种相比，体较短，全长仅3 ～4 cm。头较大，略尖。口亚上位，口裂弧形，吻圆。眼大，位于头侧。背鳍位于身体背部中央，略呈高耸向身后倾斜的三角形，共有9～10根鳍条，其起点与吻端的距离小于至尾基的距离尾柄上还有一个无鳍条的小脂鳍。

胸鳍较小呈长圆形，有10～12根鳍条，起点前部稍隆起，其起点至吻端的距离小于至尾基的距离。