元末明初当时在中原有40万蒙古人，其中只有6万人撤退到了草原，其余34万人都没回去。
归顺明朝的蒙古人多数还是被安置在了靠近草原的地区，特别是甘肃和宁夏以及内蒙和河北地区。其中许多人还被选入了明朝在边境所设立的各个卫所，参加了明朝与北元乃至后来的鞑靼政权之间的一系列战争，许多蒙古人出身的将领在这些战争中还立下战功，先后有16人因战功被明廷授予了侯爵和伯爵爵位。
另外，北京周边地区也是内附蒙古人的主要聚居地之一。公元1371年，徐达曾经将数万户投降明军的蒙古人迁到北京周边地区屯田，而在后来归附的蒙古人中也有许多被安置在了北京周边地区。此外，南京地区也是安置蒙古人的主要地区。在明朝初年，南京是明朝的首都，所以当时一些被俘的蒙古贵族和官员都被迁到了南京安置。而前文提到的纳哈出部众中也有一部分被安置到了南京。
史书记载后来投靠明朝的蒙古人中，被安置到了南京周边的例子也有不少。
