独库公路长500多千米，南端海拔约1 070米，南北贯穿了多冰川的山脉，北端海拔约750米，说明公路南北两端海拔较低，中间穿越横亘在新疆中部的天山山脉，沟通了南疆与北疆。

公路北端海拔约750米，其应位于北疆，地处天山北坡、准噶尔盆地南缘的位置，气候干旱，降水稀少，故其所处的自然带是灌丛荒漠带。