分为头、颈、躯干、尾和四肢。

它与其他爬行动物不同的特殊形态结构是它有龟壳，里面有宽短的身体，龟的外壳由拱背和扁平的腹背甲壳组成，腹背甲壳在身体的侧面延伸，并通过接缝或韧带与背背甲壳相连，这个细长的部分叫做甲壳。

头、四肢和尾巴从壳的边缘突出，通常缩回壳内(平胸龟除外)，背甲和腹甲都由两层组成，内层由几片钢板组成，外层由几片角质盾牌组成，棱皮龟根本没有角质护盾，这表明皮革般的皮肤和退化成许多小骨板。