区别是申请加盖的印章不一样。

用印申请，一般多指申请使用个人图章，例如法人私章。

用章申请，一般多指申请使用公章、合同章、部门章等系列。章的主体是以企业事业单位。章是公司经营管理活动中行使职权，明确公司各种权利义务关系的重要凭证和工具。