柬埔寨沉船事故的原因是由于船只发生故障，船只驾驶员弃船而走，造成沉船事故。

船只于9月11日从中国广州出发，17日抵达国际海域后转搭由两名柬籍船员驾驶的另一艘渔船继续航行。9月22日来到西哈努克省通岛时，渔船突然发生故障。后来两名柬籍船员被一艘快艇接走，只留下他们41人滞留在故障渔船，随后就发生了沉船事故。