官方旗舰店合作的就是第三方快递公司，包括京东物流也是给旗舰店商家选择的第三方快递，由于不是京东自营 ，京东第旗舰店是平台上的商家，也属于第三方商家

京东平台有两种，一种是自营，这种事百分百用京东快递的，一种是入住的，商家自己发货，京东超市的一般不用京东快递，因为不能保证失效，一般都是外包给美团等公司。

要是 是在京东上的旗舰店 用京东快递也没什么奇怪的

自营就是京东自己经销的，期间是品牌加盟了京东，就叫京东xxx旗舰店。但有些物品发货可能也是有京东配送的。