花两性，顶生圆锥花序，花白色或粉红色，花柱2～3个分离或基部合生，胚珠多数，蒴果膨胀成膀胱状，膜质。

珍珠黄杨树的植株一般不会超过5尺，主干呈灰褐色，并且有浅的裂痕，小的树枝呈灰绿色。它的叶子比较小，并且非常密，像一片片鱼鳞，颜色呈紫红色或者是黄绿色。花期在每年的4月份。