最好是剪掉，因为树太小，养分不足，挂不住果。

柠檬树一年四季的任何季节都可以进行修剪，不过在不同的时期修剪，方法和目的也是不一样的。

1、春季修剪：春季主要修剪新梢，疏剪新萌发的芽点，促使分枝。

2、夏季修剪：夏季修剪非常重要，先将无用芽点、瘦弱芽点、过密芽点剪掉，然后摘心处理，疏剪过密枝，最后还要结合树势进行拉枝。

3、花果期修剪：修剪发育不好的花芽，等幼果长出后还需疏果。

4、冬季修剪：将所有生长不良的枝条都剪掉，保证安全越冬。