形态不同：高效氯氰菊酯为白色结晶体，高效氯氟氰菊酯为白色固体或黄色、棕色粘稠油状液体。

作用不同：高效氯氰菊酯适用于防治棉花、蔬菜、果树、茶树、森林等多种植物上的害虫，高效氯氟氰菊酯对螨虫有较好的抑制作用。

毒性不同：高效氯氰菊酯为高毒，高效氯氟氰菊酯属神经毒剂，毒性较低。