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巨骨舌鱼主要发生在亚马逊河流域的河滩，但其确切分布的年代，特别是在盆地的下部，不得而知。

它最早被记录在圭亚那的埃塞奎博盆地，有化石证据表明其历史存在于哥伦比亚的里约热内卢马格达莱纳河(Magdelena)流域。

其原生范围之外，巨骨舌鱼已被引入到亚洲地区河流和渔业，也人工饲养于各水族馆用于观赏。