机动车在自行车道行驶的处罚为，扣3分，罚款200元。城市道路划分机动车道和自行车道的目的就是为了交通的顺畅，确保交通参与者的人生安全。自行车道为自行车专用，是禁止机动车和行人进入、借道或占用的。

机动车不会长时间占用自行车道的，一般也就是借用超车。如果机动车占用自行车道根据规定是要罚款20-200元，一般都没有罚款，一般没有造成交通事故，交管部门不会作出太重的处罚。另外，机动车道借用自行车道行驶的会被罚100元，扣2分。