螺蛳粉的臭味主要来自里面的配料酸笋。在酸笋的制作过程中，原料笋中大部分的蛋白质会被降解成氨基酸释放，同时，大量的糖类物质通过微生物的作用转化成为有机酸。

随着发酵的进行，氨基酸、有机酸以及糖等其他成分会进一步反应，转化生成醛、酸、酚、酯等物质，其中包括多种呈味物质，而酸笋的特有臭味也是这一过程的结果，它形成的主要原因是蛋白质中半胱氨酸分解释放出的硫化氢，以及色氨酸分解转化成的粪臭素等物质的共同作用。