中低档次的碧玺会有一定的裂隙，导致净度比较差。优化方式是通过浸泡折射率相近的无色油。当无色油进入裂隙后，外观上会使裂隙不明显从而提高净度，但不会影响原来的颜色。但这个过程是可逆的，除去无色油后裂隙会重新“出现”。优化在证书中不必进行特别说明。有个别操作是必须在证书中标注的，例如碧玺的充填或者添加有色油等等。这种情况视作人工处理。