路线制定的是在巴西利亚上空，N600XL的飞行高度应由37，000尺下降至36，000尺，但当时负责指示公务机的管制员，并没有指示公务机下降至指定高度。
原因一方面是当时世界其他地区的高度指示都是用人手改动，此电脑显示的各飞机飞行高度指示是由电脑自动操作更新，管制员不熟习有关电脑操作，航管员对有关的飞行高度指示产生误解。
另一方面是驾驶格莱赛号的机长不太熟悉Legacy 600的操作方式而误将答询机关闭，该控制塔的仪器自动转换成主动式雷达方式接收飞机的位置。
由于主动式雷达并不可靠，故他们在其后的记录发现出事公务机以危险飞行方式飞行，但实际该公务机当时却是以正常方式飞行
