两者相比肯定是刑侦冻结银行卡更为严重，因为刑侦冻结的话，很可能是因为你涉嫌的是刑事犯罪，而刑事犯罪是需要判刑的，而经侦大队如果冻结银行卡的话，就涉嫌有经侦上的案件，一般诈骗的话也是属于经侦上管辖，所以说两种如果相比较的话，刑侦肯定更严重一点，但是两个不管哪个部门冻结都是已经出现了违法的行为。