嫁接沙田柚一般选择同科同属的酸柚和红心柚实生苗作为砧木。

酸柚：别名绿朴，主产广西、四川、广东、福建等地。酸柚为乔化砧，嫁接沙田柚后苗期生长迅速，树冠大，主根强大，根系较发达，嫁接亲和力强，适应性广，丰产性能好，但不耐涝，是沙田柚的良好砧木。

红心柚，原产广西容县。该品种适应性强，根系发达，嫁接沙田柚后结果早，丰产稳产。