纳帕海自然保护区位于云南省迪庆藏族自治州的香格里拉县，在香格里拉县城城西北部，距县城8公里。

纳帕海自然保护区地势平坦，三面环山，冬夏季节，山岭积雪，纳曲河、奶子河等十余条河弯弯曲曲，流经草原注入纳帕海，总面积31.25平方公里，海拔3266米，湖泊积水面积660平方公里. 纳帕海其实并不是一片海，而是个季节性高山湖泊，也是云南省少有的亚热山沼泽和沼泽化草甸，纳帕海与依拉草原其实是连成一体的，丰水期是纳帕海枯水期是依拉草原。