呼伦贝尔博物馆馆内共设12个展厅，展出包括各类文物总数2866件（套），包括史前时期的呼伦贝尔展厅、夏至南北朝时期的呼伦贝尔展厅、隋唐至宋时期的呼伦贝尔展厅、元明清时期的呼伦贝尔展厅、近现代的呼伦贝尔展厅、非物质文化遗产展厅、文物数字化展厅等。

同时设有文创售卖区、简餐饮吧、母婴室、儿童娱乐区等公共服务设施。