1、品种不同：黄头龟又被称为黄头庙龟，它们属于地龟科，东方龟属的品种。黄头侧颈龟则是侧颈龟科，南美侧颈龟属，黄头侧颈龟种。

2、分布地区不同：黄头龟主要分布在泰国、柬埔寨、老挝、越南等东南亚的地区。黄头侧颈龟分布的范围比较广，在玻利维亚、巴西、圭亚那、秘鲁、苏里南、哥伦比亚、厄瓜多尔、法属圭亚那、委内瑞拉等地区都有分布。