县级三甲医院与市级三甲医院的区别主要是医院的管理隶属关系不同而已。

就三甲医院而言，这两个医院无论是医医规模、技术水平、设施施备、教学科研等应该基本在同一水平，因为三级甲等医院的评审标准是一样的，只有医院规模、技术水平、设施设备、科研教学等达到或起过评审标准时，才会被评为三甲医院。