原核的基因与真核生物的基因结构基本相同。在编码区前面的编码区上游有启动子，在编码区下游有终止子。如果没有终止子，转录不停止直到最后，可能会形成许多基因一起转录的超长mRNA。只是原核生物的基因的编码区中没有内含子和外显子。转录的mRNA不用修饰直接参加蛋白质的翻译过程。