基因遗传优点有3个：第一，稳定性。基因的分子结构稳定，不容易发生改变。基因的稳定性来源于基因的精确自我复制，并随细胞分裂而分配给子细胞，或通过性细胞传给子代，从而保证了遗传的稳定。

第二，决定性状发育。基因正是通过对酶合成的控制，以控制生物体的每一个生化过程，从而控制性状的发育。

第三，可变性。基因可以由于细胞内外诱变因素的影响而发生突变。突变的结果产生了等位基因和复等位基因。