学院创建于2002年，时名福建农林大学东方学院，属于独立学院。2019年6月，经教育部批准，由独立学院转设成为民办本科高校，更名为福州工商学院。[1]

据2021年11月学校官网显示，学院规划用地1309亩，规划总建筑面积41万平方米，已建成校园占地近800亩，建筑面积23万多平方米。下设8个二级学院和1个公共基础教学部，有专兼职教师600多人。