它们的区别如下:

1、专业工程:具有独立的设计文件,可以独立施工,竣工建成后,能独立发挥生产能力或使用效益的工程.

2、单位工程:是专业工程的组成部分,是指具有独立的设计可以独立组织施工,但竣工后不能独立发挥生产能力或使用效益的工程