琳死在卡卡西手上是因为琳知道自己被种下了三尾，回到木叶村就会被释放，木叶村会受到重创，自己也会因为失去三尾而死去，所以她选择主动死在卡卡西手中。

琳为什么选择死在卡卡西手上

琳为了保护木叶不受破坏，主动选择了死在卡卡西的雷切之下。

在神无毗桥之战不久后，琳被宇智波斑在心脏上设下符咒，体内被植入三尾计划破坏木叶，由于符咒不能使自己伤害自己，琳为了保护木叶不受破坏，主动选择了死在卡卡西的雷切之下。