大肠杆菌与硝化细菌都是原核生物，都有细胞壁、细胞膜和细胞质（含核糖体）等细胞结构，所以它们都能进行细胞呼吸，但细胞内没有细胞核和线粒体等复杂结构的细胞器。

其中大肠杆菌是异养型，只能利用现成的有机物硝化细菌是自养型，能通过化能合成作用将二氧化碳和水合成糖类，所以在生态系统中充当生产者。