如果公安局查到了行为人拥有两个户口，应当注销多余的户口，注销户口的手续通常也是按照登记时间的先后顺序来进行的，一般是注销之后登记注册的户口，之前登记的户口则依法成立生效。

根据公安部门的规定，应注销多余的户口，一般按照户口登记时间先后顺序，注销其后登记的重复户口。公安局查到了双重户口会对其中一个户口核实后进行注销处理。