真核生物的起始密码子是AUG、GUG、UUG三队。翻译对应的是甲硫氨酸。某些原核生物也以GUG和UUG为起始密码子。AUG是起始密码子，也就是说肽链起始于甲硫氨酸。这个氨基酸是甲基化的甲硫氨酸。

也就是说，甲硫氨酸一tRNA和甲酰甲硫氨酸一tRNA都是由AUG编码．但是起始氨基酸的信号要比所有其他氨基酸的信号复杂得多。