读音不同，含义不同，用法不同。

本心：1.天性，天良。2.本来的心愿。3.真心。4.草木的根株。

例句：说本心话，我很想回去，但又不愿意离开你们。

良心：①指内心对是非、善恶的正确认识：说～话|～过不去。②本谓天然的善良心性。

例句：但是她一旦离开了他，特别在夜深人静的时候，他便感觉到剧烈的良心上的痛悔。