等位基因，是位于同源染色体相同位置上，控制相对性状的一对基因。在减数分裂第一次分裂过程中，同源染色体出现联会配对，产生四分体。四分体排列在赤道板上下方，随着纺锤丝的牵引，同源染色体分离，分别移向两极，最终同源染色体分别进入不同的次级性母细胞中，从而使得位于同源染色体上的等位基因分离。