1、种属不同。

花蟹：学名远海梭子蟹，属于梭子蟹科梭子蟹属。

毛蟹：学名中华绒毛蟹，属于弓蟹科绒螯蟹属。

2、生活水域不同。

花蟹：海蟹。

毛蟹：淡水蟹。