都好，但主攻方向不一样。
生物技术主要研究现代生物学和生物技术的基本理论、基本知识和基本技能，包括分子生物学、微生物学、基因工程、发酵工程及细胞工程等方面，主要利用生物体的物质来改进产品、改良植物和动物、或为特殊用途而培养微生物。
常见的克隆、基因重组技术、生物疫苗培育皆隶属于此。
植物保护主要研究农业生物、农业生态、农业有害生物的发生发展规律及其综合治理技术等方面的基本知识和技能，进行植物有害生物的鉴定、监测、控制、治理等。
例如：植物杂草的铲除，蝗虫、疫病等农业灾害的预防与治理，农产品农药残留的检测分析等。
