在速卖通开店的时候的保证金，是可以申请退回的。不过，在退回保证金的时候，也会根据店铺的情况来看。因为保证金的主要目的就是约束商家在平台中开店的时候，不做出违规的行为。所以，在退回保证金的时候，也必须要等到店铺中所有的交易完结之后才可以申请。