1、性质不同：水冷散热器有一个进水口及出水口，散热器内部有多条水道。风冷是冷却方式的一种，即用空气作为媒介冷却需要冷却的物体。

2、特点不同：风冷通常是加大需要冷却的物体的表面积，或者是加快单位时间内空气流过物体的速率。水冷主要由散热器、水管、水泵、足够的水源组成，这就注定了大部分水冷散热系统“体积”较大，而且要求机箱内部空间足够宽余。

3、优势不同：水冷散热效果比风冷系统高出许多。