蓝宝石的主要成分是氧化铝，此外蓝宝石还含有一定铁、钛、镍等元素，这也是蓝宝石呈现出其它颜色的原因。而矿物水晶的主要成分是二氧化硅，此外还会含有少量铝、铁等元素。

蓝宝石在矿物学上属于刚玉族矿物，它是除红宝石外其它颜色刚玉宝石的统称。而矿物水晶的内部为石英结晶体，因此水晶在矿物学上属于石英族。