卫生间缝隙胶坏了是不会影响防水层的，缝隙胶坏了，卫生间的水会顺着缝隙进入到瓷砖下面，但是卫生间的防水层并不会受到影响，防水层只是为了防止室内用水、其他用水或地下水进入屋面，渗入墙体、地下室及地下构筑物，渗入楼面及墙面等而设的材料层。