硅胶越细，硅胶表面上的小孔孔径的大小影响官能团健合的密度。同等粒径的硅胶，孔径越大，硅胶的比表面积越小，硅胶表面健合的官能团密度越低，也就是C%越低反之，孔径越小，比表面积越大，官能团健合的密度越高。另外，如果用来分离生物大分子，就要选择孔径较大的(例如300A)的填料，这样才会得到充分的保留。