恐龙与科莫多巨蜥都属于爬行动物，但是从具体分类上看，恐龙属于爬行纲→双孔亚纲→主龙型次亚纲→鸟颈类主龙→恐龙总目（鸟臀目和蜥臀目，另，严格来说鱼龙目、翼龙目、盘龙目、蛇颈龙目但并不属于恐龙种类，而是个有称呼）。

科莫多巨蜥属于爬行纲→双孔亚纲→有鳞目→蜥蜴亚目→巨蜥科，很显然，两者从双孔亚纲之后就不一样了，所以区别还是很大的，我们只能说科莫多巨蜥与恐龙的关系是有共同的爬行类祖先，但是两者之间并没有直接的演化关系。