最主要的区别在于品种不同。

小琴丝竹原产中国，红杆观音竹原产日本，后被引入中国种植。

其次的显著区别是外观不同。

小琴丝竹属于丛生竹品种，生长速度较快，发芽率较快，而红杆观音竹是散生竹品种，生长速度较慢，会长竹鞭。小琴丝竹翠绿，而红杆观音竹的新杆呈现金黄色，温度降低苗杆会变红色。