使用二氧化氯的禁忌较少，只要不与其它消毒药物同时使用即可。二氧化氯消毒具有杀菌广菌、见效快、作用强、无污染、用量少等特点。

二氧化氯见光易分解，因此应保存在通风阴凉避光处。使用塑料、玻璃器皿溶解，稀释、活化二氧化氯忌用金属容器。不可与其他消毒剂混合使用。其杀菌效力随温度的降低而减弱。